ZANKER ZKF 120 B User Manual

Browse online or download User Manual for Unknown ZANKER ZKF 120 B. Dissertation - Publication Server of Goethe University Frankfurt

  • Download
  • Add to my manuals
  • Print
  • Page
    / 199
  • Table of contents
  • BOOKMARKS
  • Rated. / 5. Based on customer reviews
Page view 0
Tunikaten (Ascidiacea) der Nordsee:
Chemische Ökologie und
pharmakologisches Potential
Dissertation
zur Erlangung des Doktorgrades
der Naturwissenschaften
vorgelegt beim Fachbereich Chemische und Pharmazeutische Wissenschaften
der Johann Wolfgang Goethe - Universität
in Frankfurt am Main
von
Jana Stefanie Barenbrock
aus Münster
Frankfurt, 2004
(D F 1)
Page view 0
1 2 3 4 5 6 ... 198 199

Summary of Contents

Page 1 - Chemische Ökologie und

Tunikaten (Ascidiacea) der Nordsee: Chemische Ökologie und pharmakologisches Potential Dissertation zur Erlangung des Doktorgrades der Na

Page 3

90 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.12: Epibionten eines Aggregats von Dendrodoa grossularia. sessil/mobil Klasse Art Anzahl** Calcarea (Kalksch

Page 4

Ergebnisse und Diskussion 91 3.5 Weitere Isolate aus Ascidien Vier weitere Metaboliten wurden aus den untersuchten Ascidien isoliert und aufgeklärt

Page 5

92 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.13: NMR-Daten von Homarin aus Dendrodoa grossularia. No. δ(13C) δ(1H) Molekülgruppe COSY 1H,13C-HMBC 1 161,0

Page 6 - Inhaltsverzeichnis

Ergebnisse und Diskussion 93 01020050000100000150000200000250000300000350000400000450000500000TubastrinHomarinLichtintensität [µV] Absorption [µ

Page 7

94 Ergebnisse und Diskussion N+CH3H3CCH3CH2COO-könnte möglicherweise auch in Ascidien eine Hormon- oder Neurotransmitter-ähnliche Funktion innehaben,

Page 8

Ergebnisse und Diskussion 95 Synthese von Proteinen stören (Luckner 1984). Pflanzen, halotolerante Cyanobakterien und vestimentifere Röhrenwürmer au

Page 9 - Abkürzungen

96 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.15: NMR-Daten von Adenosin aus der Ascidie Dendrodoa grossularia. No. δ(13C) δ(1H) Molekülgruppe COSY 1H,13

Page 10

Ergebnisse und Diskussion 97 Inosin sowie vermutlich auch Guanosin sind als Bestandteile eines Pheromoncocktails des männlichen Polychaeten Nereis s

Page 11 - 1. Einleitung

98 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.16: NMR-Daten von Inosin aus der Ascidie Ascidiella aspersa. No. δ(13C) δ(1H) Molekülgruppe COSY 1H,13C-HMB

Page 12

Zusammenfassung 99 4. Zusammenfassung Tunikaten produzieren eine Vielzahl an cytotoxischen und antimikrobiellen Verbindungen, die ihnen in ihrem Öko

Page 13

Einleitung 1 1. Einleitung Naturstoffe als physiologisch wirksame Bestandteile von Pflanzen und Tieren werden seit Jahrhunderten in allen Kulturen

Page 14

100 Zusammenfassung geringe cytotoxische Effekte und keine antimikrobiellen Eigenschaften. Als weitere Metaboliten der Ascidien Dendrodoa grossularia

Page 15 - Einleitung 5

Experimenteller Teil 101 5. Experimenteller Teil Im Folgenden werden die chemischen Methoden, die bei der Extraktion der Ascidien und der Aufreinig

Page 16 - PHYLUM CHORDATA

102 Experimenteller Teil Es wurden Dünnschicht-Chromatographie-Fertigplatten aus Glas (Merck DC-Platten 5 × 10 cm RP8 F245s und Merck HPTLC-Platten

Page 17

Experimenteller Teil 103 Low Pressure Liquid Chromatography (LPLC) Zur Aufreinigung kleinerer Mengen vorgetrennter, polarer Fraktionen diente die LP

Page 18

104 Experimenteller Teil Quantifizierung von Reinsubstanzen Zur Quantifizierung von Inhaltsstoffen der Ascidie Dendrodoa grossularia wurden definierte

Page 19

Experimenteller Teil 105 5.2 Nachweis von Guanidingruppen Der Nachweis einer Guanidingruppe in einer Reinsubstanz wurde nach der Anleitung von Aute

Page 20

106 Experimenteller Teil unpolare, hydrophobe stationäre Phase, als mobile Phase werden stark polare Lösungsmittel eingesetzt. Damit werden polare Sub

Page 21

Experimenteller Teil 107 Einzig bei der Trennung einiger n-Hexanphasen stellte die RP-Säule einen Vorteil dar. Gegenüber der Diol-Säule wurden die S

Page 22 - Freiland herangezüchtet

108 Experimenteller Teil Tabelle 5.1: Trennungen einzelner Phasen von Ascidiella scabra, Corella parallelogramma und Didemnum candidum. Trennung Meng

Page 23 - Struktur Wirkung Zitat

Experimenteller Teil 109 Tabelle 5.3: Weitere Auftrennungen der Essigesterphase von Dendrodoa grossularia. Trennung Menge [mg] Methode Säule Laufm

Page 24

2 Einleitung marinen Proben und der Strukturaufklärung mittels NMR (Munro et al. 1999, Newman et al. 2003). Die Zahl aller auf der Erde lebenden Arte

Page 25

110 Experimenteller Teil 5.4 Artenvergleich Ascidiella aspersa und Ascidiella scabra 5.4.1 Morphologie Im Mai 2003 wurden auf den Orkney-Inseln 50 I

Page 26 - 2. Methoden

Experimenteller Teil 111 Eier wurden bei der Präparation meist schon ausgestoßen und konnten im Umkreis des Tieres mit einer Pipette eingesammelt un

Page 27

112 Experimenteller Teil 5.5 Bioassays 5.5.1 Phytagel-Assay Um Extrakte aus Ascidien und Schwämmen auf ihre besiedlungshemmende Wirkung zu testen, w

Page 28

Experimenteller Teil 113 2 Replikate). Als Kontrolle diente im ersten Versuch jeweils ein Gel pro Platte, dem ausschließlich 1,5 ml Methanol zugegeb

Page 29

114 Experimenteller Teil 5.5.2 Antimikrobieller Assay Mit Hilfe des Agar-Diffusions-Assays wurde die antimikrobielle Aktivität von Ascidienextrakten

Page 30

Experimenteller Teil 115 Tabelle 5.5: Systematische Einordnung und Herkunft der in dem Agar-Diffusions-Test verwendeten Bakterienstämme. Taxonomisch

Page 31

116 Experimenteller Teil Die Bakterien wurden in Flüssigmedien kultiviert. Zur Testung wurde ein Festagar des entsprechenden Nährmediums in Petrischal

Page 32

Experimenteller Teil 117 Abbildung 5.4: Ermittlung der Hemmhofbreite über die digitale Auswertung. Foto eines Blättchens des Agar-Diffusions-Tests.

Page 33

118 Experimenteller Teil Auf die beiden seitlichen Stege wird ein Deckglas aufgelegt, in das Zählnetze eingraviert sind. Dadurch entsteht an den Mitte

Page 34 - (orange) dargestellt

Experimenteller Teil 119 (3000 Upm, 5 min) wurde der Überstand ausgeschlagen und die wells zwei Mal mit je 100 µl PBS gespült. Das gebildete Formaza

Page 35

Einleitung 3 1.1 Systematik und Biologie von Ascidien Tunikaten (Manteltiere) fanden erstmals bei Aristoteles Erwähnung, der den Begriff „THALIA“ f

Page 36

120 Experimenteller Teil Factor Receptor (EGFR), wurde in Tyrosin-Kinase-Puffer (TK-Puffer) verdünnt. Der Puffer enthält Magnesium, Mangan und ATP. EG

Page 37

Experimenteller Teil 121 Referenz gewählt und die PTK-Aktivität in den wells mit den Substanzproben und dem Hemmstoff als Restaktivität in Relation

Page 38

122 Literaturverzeichnis 6. Literaturverzeichnis Aiello A, Carbonelli S, Esposito G, Fattorusso E, Iuvone T & Menna M, 2001a. Turbinamide, a new

Page 39

Literaturverzeichnis 123 Bandaranayake WM, Bourne DJ & Sim RG, 1997. Chemical composition during maturing and spawning of the sponge Dysidea herb

Page 40

124 Literaturverzeichnis Blunt JW, Copp BR, Munro MHG, Northcote PT & Prinsep MR, 2004. Marine Natural Products. Natural Products Report 21. 1-49.

Page 41

Literaturverzeichnis 125 Davis AR, Targett NM, McConnell OJ & Young CM, 1989a. Epibiosis of marine algae and benthic invertebrates: natural produ

Page 42

126 Literaturverzeichnis Green KM, Russell BD, Clark RJ, Jones MK, Garson MJ, Skilleter GA & Degnan BM, 2002. A sponge allelochemical induces asci

Page 43

Literaturverzeichnis 127 Issa HH, Tanaka J, Rachmat R & Higa T, 2003. Floresolides, new metacyclophane hydroquinone lactones from an ascidian Apl

Page 44

128 Literaturverzeichnis Kourany-Lefoll E, Laprévote O, Sévenet T, Montagnac A & Pais M, 1994. Phloeodictines A1-A7 and C1-C2, antibiotic and cyto

Page 45 - Siphonöffnungen

Literaturverzeichnis 129 McKee TC, Galinis DL, Pannell LK, Cardellina JH, Laakso J, Ireland CM, Murray L, Capon RJ & Boyd MR, 1998. The lobatamid

Page 46

4 Einleitung (soziale Arten) oder von einer gemeinsamen Tunika umschlossen (Synascidien). Artspezifische Unterschiede sind in der Färbung, Festigkeit

Page 47

130 Literaturverzeichnis devices, and its hemolytic and precipitation potential upon i.v. administration. Anti-Cancer Drugs 10. 879-887. Okazaki Y &am

Page 48

Literaturverzeichnis 131 Rinehart K, Sakai R, Holt TG, Fregeau NL, Perun TJJ, Seigler DS, Wilson GR & Shield LS, 1990a. Biologically active natur

Page 49

132 Literaturverzeichnis Structure-activity relationships of the didemnins. Journal of Medical Chemistry 39. 2819-2834. Schlegel HG & Zaborosch C,

Page 50 - Inkubation (b)

Literaturverzeichnis 133 Teo SL-M & Ryland J, 1995. Potential antifouling mechanisms using toxic chemicals in some British ascidians. Journal of

Page 51

134 Literaturverzeichnis Watanabe K, Uehara H, Sato M & Konosu S, 1985. Seasonal variation of extractive nitrogenous constituents in the muscle of

Page 52

Literaturverzeichnis 135 Zeeck E, Harder T & M. B, 1998. Inosine, L-glutamic acid and L-glutamine as components of a sex pheromone complex of the

Page 53

136 Abbildungsverzeichnis 7. Abbildungsverzeichnis Abbildung 1.1: Schematische Darstellung einer solitären Ascidie...

Page 54 - Versuch 1

Abbildungsverzeichnis 137 Abbildung 3.13: Cytotoxische Aktivität der aufgetrennten Essigesterphase von Dendrodoa grossularia...

Page 55

138 Abbildungsverzeichnis Abbildung 3.36: Aggregate von Dendrodoa grossularia. ... 89 Abbildu

Page 56 - 012345678

Tabellenverzeichnis 139 8. Tabellenverzeichnis Tabelle 1.1: Bisher aus den in dieser Arbeit eingesetzten Ascidien isolierte Verbindungen und deren b

Page 57

Einleitung 5 Abbildung 1.1: Schematische Darstellung einer solitären Ascidie. Schema einer solitären, von einer Tunika umschlossenen Ascidie, die b

Page 58

140 Tabellenverzeichnis Tabelle 9.1: Übersicht über den Bewuchs der einzelnen Extraktgele im Phytagel-Versuch 1... 168 Tabelle 9.2: Übersicht über den

Page 59

Anhang 141 9. Anhang 9.1 Beschreibung der bearbeiteten Ascidien Die Darstellung der Arten basiert auf Literaturbeschreibungen (Berrill 1950, Milla

Page 60

142 Anhang Ascidiella aspersa (Müller, 1776) Biologie Wuchsform Solitär, meist mehrere Individuen in dichten Aggregaten, auch aufeinander wach

Page 61

Anhang 143 Ascidiella aspersa (Müller, 1776) Chemie ja058, ja183, ja184Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol

Page 62

144 Anhang Ascidiella scabra (Müller, 1776) Biologie Wuchsform Solitär. Verbreitung Irland, Irische See, Großbritannien und Nordsee bis zu den

Page 63

Anhang 145 Ascidiella scabra (Müller, 1776) Chemie ja101Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 57,15 g

Page 64

146 Anhang Ascidia virginea Müller, 1776 Biologie Wuchsform Solitär. Verbreitung Irland, Irische See, Großbritannien, Norwegen. Nördlich bis S

Page 65

Anhang 147 Ascidia virginea Müller, 1776 Chemie ja102Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 3,87 g 1,

Page 66

148 Anhang Ascidia mentula Müller, 1776 Biologie Wuchsform Solitär. Verbreitung Irland, Irische See, Großbritannien, seltener aber a

Page 67

Anhang 149 Ascidia mentula Müller, 1776 Chemie ja103Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 30,86 g 8,

Page 68 - MIC [µg/ml]

6 Einleitung Abbildung 1.2: Stammbaum der Ascidiacea. Systematische Einordnung der in dieser Arbeit untersuchten Ascidienarten in das Phylum Chordat

Page 69

150 Anhang Aplidium punctum (Giard, 1873) Biologie Wuchsform Koloniebildend. Verbreitung Süd- und Westküste Großbritanniens. Habitat/Substrat S

Page 70

Anhang 151 Aplidium punctum (Giard, 1873) Chemie ja104/ja116Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 24,

Page 71

152 Anhang Botrylloides leachi (Savigny, 1816), Mäander-Seescheide Biologie Wuchsform Koloniebildend. Verbreitung Großbritannien, Nord-Norwegen

Page 72

Anhang 153 Botrylloides leachi (Savigny, 1816) Chemie ja105Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 51,0

Page 73 - D. candidum

154 Anhang Botryllus schlosseri (Pallas, 1766), Sternascidie Biologie Wuchsform Koloniebildend. Verbreitung Großbritannien, Nord-Norwegen bis M

Page 74

Anhang 155 Botryllus schlosseri (Savigny, 1816) Chemie ja106Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 3,3

Page 75

156 Anhang Corella parallelogramma (Müller, 1776), Gasmantelascidie Biologie Wuchsform Solitär. Verbreitung Großbritannien, Norwegen bis Mittel

Page 76

Anhang 157 Corella parallelogramma (Müller, 1776) Chemie ja107Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 9

Page 77 - Enzymaktivität [%]

158 Anhang Dendrodoa grossularia (van Beneden, 1846), Tangbeere Biologie Wuchsform Solitär, in dichten Aggregaten. Verbreitung Großbritannien

Page 78

Anhang 159 Dendrodoa grossularia (van Beneden, 1846) Chemie ja108, ja120Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol

Page 79 - Effekt Breitband

Einleitung 7 Als sessile Invertebraten mussten Ascidien spezielle Abwehrmechanismen in der Interaktion mit Nachbarorganismen, Fraßfeinden und Epibio

Page 80

160 Anhang Didemnum candidum Savigny, 1816, “White Sponge Tunicate” Biologie Wuchsform Koloniebildend. Verbreitung West- und Südküste Großbrit

Page 81

Anhang 161 Didemnum candidum Savigny, 1816 Chemie ja109, ja121Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 4

Page 82

162 Anhang Polyclinum aurantium Milne-Edwards, 1841 Biologie Wuchsform Koloniebildend. Verbreitung Großbritannien, West-Norwegen bis Mittelmeer

Page 83 - Wasserphase

Anhang 163 Polyclinum aurantium Milne-Edwards, 1841 Chemie ja110Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser

Page 84

164 Anhang Sidnyum turbinatum Savigny, 1816 Biologie Wuchsform Koloniebildend. Verbreitung Großbritannien, Norwegen bis Mittelmeer. Habitat/Sub

Page 85

Anhang 165 Sidnyum turbinatum Savigny, 1816 Chemie ja111Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 24,26 g

Page 86 - 76 Ergebnisse und Diskussion

166 Anhang Trididemnum cereum (Giard, 1872) Biologie Wuchsform Koloniebildend. Verbreitung Großbritannien. Habitat/Substrat Unterer Gezeitenbe

Page 87

Anhang 167 Trididemnum cereum (Giard, 1872) Chemie ja112Ausbeute Probenmenge, getrocknet Rohextrakt n-Hexan Essigester n-Butanol Wasser 26,94 g

Page 88

168 Anhang 9.2 Ergebnisse des Phytagel-Assays Tabelle 9.1: Übersicht über den Bewuchs der einzelnen Extraktgele im Phytagel-Versuch 1. Extrakt Leit

Page 89

Anhang 169 Tabelle 9.2: Übersicht über den Bewuchs der einzelnen Extraktgele im Phytagel-Versuch 2. Extrakt LeiterBewuchs-grad Balaniden Hydrozoen

Page 90

8 Einleitung solitäre Ascidien in der Tunika so genannte Blasenzellen, die Schwefelsäure beinhalten (Pirie et al. 1984). Stoecker (1980a, b) zeigte e

Page 91 - Transmittance [%]

170 Anhang 012345678910A. virginea RC. parallelogramma RA. punctum RKontrollenD. candidum RA. scabra RA. mentula RD. grossularia ED. grossularia RD.

Page 92 - Intensität

Anhang 171 051015202530354045D. candidum RD. grossularia BA. scabra RKontrollenD. grossularia RD. grossularia EA. mentula RC. parallelogramma RA. v

Page 93

172 Anhang 9.3 Medien und Ergebnisse des antimikrobiellen Assays Tabelle 9.3: Übersicht über die eingesetzten Bakterienstämme. Bakterienstamm DSMZ

Page 94

Anhang 173 Tabelle 9.4: Zusammensetzung der Nährmedien. 2216E Nr. 1 Nr. 1M Nr. 790 Nr. 67 Nr. 54 Nr. 53 Nr. 97 Nr. 65 Nr. 222 Nr. 607(NH4)

Page 95

174 Anhang Tabelle 9.5: Ergebnisse des Hemmhoftests Actinobacteria Proteobacteria High GC Low GC α β γ Flavo/ Cytoph. A. Pl. Organismus Gram-posi

Page 96

Anhang 175 Tabelle 9.6: Ergebnisse des Konzentrationsversuchs. Actinobacteria Proteobacteria High GC Low GC α γ Flavo/ Cytoph. Gram-positive bac

Page 97

176 Anhang 9.4 Ergebnisse des cytotoxischen Assays Benennung der Proben: ja108/ja120 Dendrodoa grossularia Sammlung 2001/2003 ja109/ja121 Didemnum

Page 98

Anhang 177 Fortsetzung von Tabelle 9.7. Probe Konz [µg/ml] MIC [µg/ml]ZKF HPLC-Platte Tox [min] MT-Befund ER-Befund ja108/B/L13/D0 1000 nein ne

Page 99

178 Anhang Fortsetzung von Tabelle 9.7. Probe Konz [µg/ml] MIC [µg/ml]ZKF HPLC-Platte Tox [min] MT-Befund ER-Befund ja109/EE/D1 1000 nein ja

Page 100

Anhang 179 9.5 Ergebnisse des Protein-Tyrosin-Kinase-Assays In den folgenden Tabellen finden sich die Restaktivitäten des Enzyms [%] bei Inkubation

Page 101 - 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1

Einleitung 9 1.2 Naturstoffe aus Ascidien Ascidien sind vor allem auf marinen Hartböden weltweit dominierende Organismen. Ihr Erfolg im inter- als

Page 102 - H) angegeben

180 Anhang Tabelle 9.9: Enzymhemmung der aufgetrennten Essigesterphase von Corella parallelogramma, der aufgetrennten n-Hexanphase von Didemnum candi

Page 103 - Retentionszeit [min]

Anhang 181 Tabelle 9.11: Enzymhemmung der aufgetrennten Essigesterphase von Dendrodoa grossularia (Sammlung 2001). Probe Aktivität (%) Konz. [mg/ml]

Page 104 - Absorption [µV]

182 Anhang Tabelle 9.12: Enzymhemmung in den Konzentrationsversuchen mit verschiedenen Extrakten und Reinsubstanzen. Konzentration [µ/ml] Probe 100

Page 105

Danksagung 183 Danksagung Die vorliegende Arbeit wurde am Institut für Organische Chemie der Johann Wolfgang Goethe-Universität in Frankfurt am Main

Page 106

184 Danksagung Gunnar Gerdts und Antje Wichels möchte ich für die wertvollen Ideen und die Unterstützung während der Aufenthalte auf Helgoland danken

Page 107

Lebenslauf 185 Lebenslauf Jana Stefanie Barenbrock Geburtdatum: 24.03.1974 Frenssenstrasse 52 Geburtsort: Münster 27576 Bremerhaven jbarenbrock

Page 108

186 Lebenslauf Hochschulstudium 04/1999 – 03/2000 Diplomarbeit in der Abteilung ‚Vergleichende Neurobiologie’ bei Prof. Dr. H. Bleckmann: „Diskri

Page 111 - 5. Experimenteller Teil

Erklärung Hiermit erkläre ich, dass ich die vorliegende Arbeit selbständig und nur unter Zuhilfenahme der genannten Literatur un

Page 112

Barenbrock, Jana S. Tunikaten (Ascidiacea) der Nordsee: Chemische Ökologie und pharmakologisches Potential. vom Fachbereich Chem

Page 113

10 Einleitung OONNCH3NHH3COCH3COH3COHOHOOCH3CH3OHOOS Abbildung 1.3: Strukturformel von Ecteinascidin 743 (1). Ecteinascidin wurde aus der Ascidie Ect

Page 114

Einleitung 11 CHNCCHNHCCHCCHOCH2CHNCCHCHOCHCNCOCHHC(CH3)2HCOCH3O(CH3)2CHCH2OOH3CCH2CH2H2CH2COCH3OH3CNHOCHOHCCHOCH2CH(CH3)2NH3CONOOHCH2CH3H3C Abbildu

Page 115

12 Einleitung langfristig die aufwändige und ertragsarme Extraktion des Wirkstoffes aus Ascidien abgelöst werden können (Corey et al. 1996, Martinez

Page 116

Einleitung 13 Tabelle 1.1: Bisher aus den in dieser Arbeit eingesetzten Ascidien isolierte Verbindungen und deren biologische Wirkung. Struktur W

Page 117

14 Einleitung NHOSNNNH3CCH3 NHNNONOCH3CH3 NHNNHNNCH3H3CONH NHNNHNNCH3H3COOH Abbildung 1.6: Dendrodoin (3) und Alboinon (4) sowie die Grossularine 1

Page 118

Einleitung 15 1.3 Zielsetzung der Arbeit Ziel der vorliegenden Arbeit war es, Ascidien der Nordsee auf ihre biologisch-chemischen Eigenschaften und

Page 119

16 Methoden 2. Methoden 2.1 Materialsammlung Die im Rahmen dieser Arbeit untersuchten Ascidienarten wurden während zweier Forschungsfahrten der FS

Page 120

Methoden 17 Zusätzlich zu den Proben von den Orkney-Inseln konnten Extrakte der Art Ascidiella aspersa getestet werden, die aus einem BMBF-Projekt (

Page 121

18 Methoden werden von sessilen Filtrierern wie Schwämmen, Tunikaten, Hydrozoen, Bryozoen und Balaniden dominiert. An mobilen Arten sind Nackt- und G

Page 122

Methoden 19 Tauchplatz 1: Tuquoy Bay, Westray Die Tuquoy Bay (Abbildung 2.2) liegt an der südöstlichen Seite der Insel Westray. Sie ist damit sehr g

Page 124

20 Methoden Tauchplatz 2: Red Nev Das Gebiet Red Nev bezeichnet die Westseite der Insel Westray und liegt in einem starken Strömungs-, Wellen- und Ge

Page 125

Methoden 21 Tauchplatz 3: Saviskaill Bay Die Saviskaill Bay (Abbildung 2.6) liegt im Norden der Insel Rousay. Sie bildet die südliche Begrenzung des

Page 126

22 Methoden 2.2.2 Helgoland und Doggerbank Die Nordsee hat als typisches Schelfmeer eine mittlere Tiefe von 70 Metern. Der Meeresboden der südlichen

Page 127

Methoden 23 Die Doggerbank liegt etwa auf Höhe der mittelenglischen Grafschaft Yorkshire und erstreckt sich Richtung Jütland und Skagerrak (Abbildun

Page 128

24 Methoden 2.3 Chemische Methoden 2.3.1 Extraktion Die gesammelten Organismen wurden in gefrorenem Zustand in einer Gefriertrocknungsanlage vollst

Page 129

Methoden 25 2.3.2 Chromatographische Methoden Die durch die Extraktion gewonnenen Substanzgemische wurden mit Hilfe von verschiedenen chromatograph

Page 130

26 Methoden 2.4 Artenvergleich Ascidiella aspersa und Ascidiella scabra Die systematische Einordnung von Ascidiella aspersa und Ascidiella scabra is

Page 131

Methoden 27 2.5.1 Phytagel-Assay Ascidien besitzen je nach Art unterschiedlich starken Aufwuchs. Es konnten dabei Unterschiede im epibiontischen Be

Page 132 - 6. Literaturverzeichnis

28 Methoden Die Schwimmbadmole ist eine Betonbefestigung an der östlichen Seite der Insel. Sie zeichnet sich durch ihren dichten Bewuchs mit Algen un

Page 133

Methoden 29 2.5.2 Antimikrobieller Assay Die antimikrobielle Aktivität von Ascidienextrakten wurde mit Hilfe des Agar-Diffusions-Assays geprüft. De

Page 135

30 Methoden 2.5.3 Cytotoxischer Assay Die im antimikrobiellen Assay getesteten Proben wurden auf ihre cytotoxische Wirkung auf Mausfibroblasten unte

Page 136

Methoden 31 2.5.4 Protein-Tyrosin-Kinase-Assay Der Protein-Tyrosin-Kinase-Assay stellt ein Testsystem dar, in dem Substanzgemische und Reinsubstanz

Page 137

32 Ergebnisse und Diskussion 3. Ergebnisse und Diskussion Die beschriebenen Versuche wurden während des Zeitraums der Arbeit parallel durchgeführt. M

Page 138

Ergebnisse und Diskussion 33 morphologischen Einordnung. Andererseits konnten mit den neuen Methoden auch unsichere systematische Verwandtschaftsbez

Page 139

34 Ergebnisse und Diskussion Abbildung 3.2: Schema zur Vermessung der äußeren Morphologie. Darstellung der Parameter, die zum Vergleich der äußeren M

Page 140

Ergebnisse und Diskussion 35 010203040506070010203040506070 Anzahl Körpermaße [mm]Longitud.GefäßeOraleTentakelSiphon-öffnungenbSiphoneaBreiteLänge A

Page 141

36 Ergebnisse und Diskussion Abbildung 3.4: Morphologische Merkmale von Ascidiella aspersa und Ascidiella scabra. Literaturbeschreibung der äußeren M

Page 142

Ergebnisse und Diskussion 37 Als Unterscheidungskriterium von systematischem Rang wurde die Morphologie der Eier betrachtet (Abbildung 3.4). Die Eie

Page 143

38 Ergebnisse und Diskussion 01020020000040000060000080000010000001200000Lichtintensität [µV]Retentionszeit [min] 010200200000400000600000800000100000

Page 144

Ergebnisse und Diskussion 39 Sequenzen meist erst bei fern verwandten Arten auftreten (White et al. 1990, Coleman et al. 1997). Der Sequenzvergleich

Page 146 - 7. Abbildungsverzeichnis

40 Ergebnisse und Diskussion Abbildung 3.8: Eine der Phytagel-Platten vor und nach der Inkubation. Zu sehen ist eine der Phytagel-Platten mit zwö

Page 147

Ergebnisse und Diskussion 41 wiederholt, wobei die Gele in Abständen von drei bis sechs Tagen begutachtet wurden, um den Fortgang des Bewuchses zu k

Page 148

42 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.1: Algendichte und Anzahl der sessilen bzw. assoziierten Epibionten der Extraktgele der Versuche 1 und 2. Vers

Page 149 - 8. Tabellenverzeichnis

Ergebnisse und Diskussion 43 Der sprunghafte Anstieg des Balanidenbesatzes sowie das Auftreten der neuen Arten im zweiten Versuch machen deutlich, d

Page 150

44 Ergebnisse und Diskussion 0510152025303540455055Versuch 2Versuch 1Kat. 3Kat. 2Kat. 1Kat. 4Kat. 3Kat. 2Kat. 1Anzahl Organismen Abbildung 3.9: Anzahl

Page 151 - 9. Anhang

Ergebnisse und Diskussion 45 3.2.2 Antimikrobieller Assay Mit dem Agar-Diffusions-Assay sollten antimikrobielle Effekte der Ascidienextrakte nachge

Page 152 - Biologie

46 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.2: Anzahl der durch jede Ascidienart gehemmten Bakterienstämme. Art Gehemmte Bakterienstämme Ascidiella scabra

Page 153 - Chemie ja058, ja183, ja184

Ergebnisse und Diskussion 47 drei Ascidienarten ausschließlich marine Bakterien, dass aber insgesamt mehr marine als terrestrische Bakterienstämme i

Page 154

48 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.3: Anzahl der die jeweiligen Bakterienstämme hemmenden Ascidienarten. Organismus * Aktive Ascidien Gram-positi

Page 155 - Chemie ja101

Ergebnisse und Diskussion 49 Tabelle 3.4: Bewertung der ausgemessenen Hemmhöfe nach ihrer Breite. Actinobacteria Proteobacteria High GC Low GC α β

Page 156

Inhaltsverzeichnis Inhaltsverzeichnis 1. Einleitung ...

Page 157 - Chemie ja102

50 Ergebnisse und Diskussion Bakterien sind die ersten Organismen, die eine freie Oberfläche im marinen Habitat kolonisieren. Der resultierende Biofil

Page 158 - Ascidia mentula Müller, 1776

Ergebnisse und Diskussion 51 Einige Bakterienstämme induzierten verstärktes Wachstum oder Verfärbungen der Bakterienkolonien. Extrakte von Ascidiell

Page 159 - Chemie ja103

52 Ergebnisse und Diskussion Abbildung 3.11: Durch Inkubation mit Ascidienextrakten verfärbte Bakterienkolonien. Gelb (a) bzw. rosa (b) gefärb

Page 160

Ergebnisse und Diskussion 53 et al. 1989b, Teo et al. 1994, Ramasamy et al. 2003). Auffällige Unterschiede in diesen Versuchen sind die beobachteten

Page 161 - Chemie ja104/ja116

54 Ergebnisse und Diskussion 3.2.3 Cytotoxischer Assay Cytotoxische Aktivität von Ascidienextrakten ist seit langem bekannt. Die Arten Didemnum molle

Page 162

Ergebnisse und Diskussion 55 Tabelle 3.5: Cytotoxische Aktivität der untersuchten Ascidien. Art aktive Phase Sammlung 2001 Sammlung 2003 Ascidia

Page 163 - Chemie ja105

56 Ergebnisse und Diskussion charakteristische Organellen angefärbt. Es ergaben sich bei Extrakten aus den Ascidien Dendrodoa grossularia und Didemnum

Page 164

Ergebnisse und Diskussion 57 3.2.3.1 Auftrennung der n-Hexanphase von Aplidium punctum Die n-Hexanphase von Aplidium punctum wurde über präparativ

Page 165 - Chemie ja106

58 Ergebnisse und Diskussion 3.2.3.2 Weitere Auftrennung der Essigesterphase von Dendrodoa grossularia Die Essigesterphase von Dendrodoa grossularia

Page 166

Ergebnisse und Diskussion 59 Apoptose sind unter anderem die Kondensation der genomischen DNS zu einer sichelförmigen Masse an der Zellkernperipheri

Page 167 - Chemie ja107

Inhaltsverzeichnis 3.4.4 Zusammenfassung der biologischen Aktivität von Dendrodoa grossularia.. 88 3.5 Weitere Isolate aus Ascidien ...

Page 168

60 Ergebnisse und Diskussion Normale Zellmorphologie Morphologische Veränderungen ER und Zellkerne sichelförmige Zellkerne Mitosespindel multipol

Page 169 - Chemie ja108, ja120

Ergebnisse und Diskussion 61 3.2.3.3 Auftrennung des Essigesterextraktes von Didemnum candidum Die Essigesterphase von Didemnum candidum wurde durc

Page 170

62 Ergebnisse und Diskussion im ER benötigen, nicht stattfinden. Vakuolen mit Abbauprodukten akkumulieren daher im ER. Bei einer Untersuchung der akti

Page 171 - Chemie ja109, ja121

Ergebnisse und Diskussion 63 sichelzellförmigeZellkernemultipolareMitosespindelnCentrosomensichtbar17 FraktionenEssigesterphaseD. grossulariaalle Fr

Page 172

64 Ergebnisse und Diskussion 3.2.4 Protein-Tyrosin-Kinase-Assay Mit dem Protein-Tyrosin-Kinase-Assay können enzymhemmende Eigenschaften von natürlich

Page 173 - Chemie ja110

Ergebnisse und Diskussion 65 Tabelle 3.6: Aktivität des EGFR bei Inkubation mit Extrakten von zwölf Ascidienarten der Sammlung 2001. Art Rohextrakt

Page 174

66 Ergebnisse und Diskussion 3.2.4.1 Moderate Inhibition: Auftrennung der Fraktionen und Sammlung 2003 Die drei moderat aktiven Fraktionen der Arten

Page 175 - Chemie ja111

Ergebnisse und Diskussion 67 nachweisbar. Die zuvor beobachtete Wirkung scheint daher kein kontinuierlicher Effekt zu sein, sondern könnte mit der H

Page 176

68 Ergebnisse und Diskussion Die weitere Auftrennung beider Fraktionen wurde durch PTK-Assays begleitet. So konnte die Aktivität verfolgt und die weit

Page 177 - Chemie ja112

Ergebnisse und Diskussion 69 Dendrodoa grossularia wurden im Phytagel-Versuch gar nicht von Invertebraten besiedelt, ließen aber nur sehr schwache a

Page 179

70 Ergebnisse und Diskussion sich die Frage, inwiefern Ascidien der Nordsee überhaupt Substanzen zum Fraßschutz synthetisieren müssen, da gemeinhin de

Page 180 - Anzahl Organismen

Ergebnisse und Diskussion 71 3.4 Isolierung von Reinsubstanzen aus Dendrodoa grossularia 3.4.1 Bioassay-guided Fractionation Die enzyminhibierende

Page 181

72 Ergebnisse und Diskussion Abbildung 3.19: 1H-NMR-Spektren der aktiven Fraktionen aus der n-Butanolphase von Dendrodoa grossularia. Das Spektrum de

Page 182

Ergebnisse und Diskussion 73 15 Fraktionenn-Butanolphase9 Hauptfraktionen1 Fraktioninaktiv4 Fraktionenmoderat hemmend8 Fraktionenstark hemmend2 Fra

Page 183 - Anhang 173

74 Ergebnisse und Diskussion 3.4.1.2 Fraktionierung der Essigesterphase Die Auftrennung der Essigesterphase über Größenausschlußchromatographie ergab

Page 184 - 174 Anhang

Ergebnisse und Diskussion 75 0 5 10 15 20 2502000004000006000008000001000000 Lichtintensität [µV]Retentionszeit [min] 020000040000060000080000010

Page 185 - Anhang 175

76 Ergebnisse und Diskussion 17 FraktionenEssigesterphase1 Fraktioninaktiv2 Fraktionenmoderat hemmend14 Fraktionenstark hemmend12 Hauptfraktionen1 Fra

Page 186

Ergebnisse und Diskussion 77 3.4.2 Identifizierung des EGFR-Inhibitors Tubastrin Über HR-ESI-MS der Substanz EL10X3 wurde C9H11N3O2 (m/z = 194,0922

Page 187

78 Ergebnisse und Diskussion Die Stickstoffatome wurden in einer Guanidingruppe vermutet, die über einen Sakaguchi-Test (Auterhoff et al. 1977) nachge

Page 188

Ergebnisse und Diskussion 79 Sakaguchi-Reaktion mit einem aus einem Schwamm isolierten Tubastrin-Derivat (Urban et al. 1994, Abbildung 3.28) angesic

Page 189

Abkürzungen Abkürzungen ANOVA Analysis of Variance ATP Adenosin-Triphosphat COSY Correlated Spectroscopy δ chemische Verschiebung (in ppm) DAPI

Page 190

80 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.8: NMR-Daten von Tubastrin aus der Koralle Tubastrea aurea a) (Sakai et al. 1987) und der Ascidie Dendrodoa gro

Page 191 - (Sammlung 2001)

Ergebnisse und Diskussion 81 HOHOHNNH2HHNH1234567891011 HNNH2HHNH2HOCl- Abbildung 3.28: Strukturformeln von Tubastrin (7) und einem Tubastrin-Deriv

Page 192

82 Ergebnisse und Diskussion Tabelle 3.9: IR-Daten von Tubastrin aus Dendrodoa grossularia im Vergleich zu den Literaturwerten von Sakai et al. (1987)

Page 193 - Danksagung

Ergebnisse und Diskussion 83 MS/MS-Spektrometrie führte zu Fragmenten von m/z = 152 [M-CH2N2]+, 135 [M-CH5N3]+ und 107 [M-C2H5N3O]+ (Abbildung 3.30)

Page 194

84 Ergebnisse und Diskussion Ein Konzentrationsversuch ergab einen IC50-Wert von Tubastrin von 34,6 µg/ml (179,2 µM). Tubastrin zeigte damit eine deut

Page 195 - Jana Stefanie Barenbrock

Ergebnisse und Diskussion 85 Ein weiterer in der Struktur ähnlicher EGFR-Hemmstoff ist das aus einem Actinomyceten isolierte Erbstatin. Der IC50-Wer

Page 196

86 Ergebnisse und Diskussion Obwohl der 3,4-Dihydroxyphenylrest als auch die zentrale Doppelbindung bei Tubastrin vorhanden sind, liegt die Hemmwirkun

Page 197

Ergebnisse und Diskussion 87 3.4.3 Physiologische und ökologische Bedeutung von PTK-beeinflussenden Substanzen Protein-Tyrosin-Kinasen (PTKs) bilde

Page 198

88 Ergebnisse und Diskussion 3.4.4 Zusammenfassung der biologischen Aktivität von Dendrodoa grossularia Extrakte aus Dendrodoa grossularia waren in a

Page 199

Ergebnisse und Diskussion 89 Abbildung 3.36: Aggregate von Dendrodoa grossularia. Das Lineal dient als Referenz für die Größe der Aggregate, deren

Comments to this Manuals

No comments